Mit seinen Verbindungen zu auswärtigen Fakultäten bietet das Evangelische Stift seinen Stipendiatinnen und Stipendiaten die Möglichkeit zur Teilnahme an verschiedenen Austauschprogrammen. Im Gegenzug verbringen Studierende aus den jeweiligen Orten und andere ökumenische Gäste ein bis zwei Semester hier im Haus und tragen zum ökumenischen Lernen der Studierenden bei.

Es bestehen derzeit Austauschprogramme mit: Edinburgh, Greifswald, Straßburg und Yale.

Außerdem besteht die Möglichkeit zu einem Studienjahr in Rom und Minsk.

Für Greifswald ist sowohl im Winter- als auch im Sommersemester eine Bewerbung möglich, für alle anderen Orte erfolgt die Bewerbung jeweils im Wintersemester für das Studienjahr, das im darauffolgenden Herbst beginnt.

Termine und Merkblätter sind, soweit vorhanden, im Ephoratssekretariat erhältlich.

Hauptbestandteil der im Ephorat einzureichenden Unterlagen ist eine persönliche Begründung für die Bewerbung um einen Austauschplatz. Dazu kommt  ein - derzeit noch formloser - Antrag.

Mit den am Austausch Interessierten werden Gespräche mit einer Auswahlkommission geführt, der 2 Mitglieder des Repetentenkollegiums, eine Person aus der Stiftsvertretung und ein/e Studierende/r, der/die den Austauschort kennt, angehören.

Termin für die Auswahlgespräche ist in der Regel der Tag nach dem Weihnachtsfest. Die Bewerber/innen werden rechtzeitig vom Seniorrepetent/der Seniorrepetentin dazu angeschrieben.

Die Kommission hört die einzelnen Bewerber/innen an und erstellt einen Auswahlvorschlag für den Stiftsrat. Der Stiftsrat entscheidet aufgrund des Vorschlags. Eine Kriterienliste für die Auswahl wurde am 30.11.1999 im Forum festgelegt, Informationen über Entscheidungen in der Kommission werden jedoch nicht gegeben.